מסלול הלימודים הינו דו חוגי.
ניתן לשלב חוג נוסף מהמסלול היסודי או העל יסודי.
החוגים במסגרת המסלול היסודי:
ספרות, מקרא, לשון, מתמטיקה וטבע ומדע.
החוגים במסגרת המסלול העל יסודי:
מדעי הרוח- B.A:
החוג לאנגלית
החוג למקרא
החוג לספרות דרמה ומבע יצירתי
החוג למחשבת ישראל
החוג להיסטוריה
החוג ללשון עברית
החוג ללימודים רב תחומיים
מדעי החברה – B.Ed:
החוג לחינוך חברתי קהילתי - חח"ק
המכון והחוג לאמנות
החוג לגיאוגרפיה ולימודי סביבה
החוג ללימודי ארץ ישראל
החוג לסוציולוגיה
החוג לאזרחות ולימודי דמוקרטיה
החוג להוראת השפה הערבית
החוג לתקשורת
החוג למחשבת ישראל עוסק בהגות היהודית לדורותיה על רקע החיפוש אחר הגדרה חדשה של זהות יהודית ואחר חיים של משמעות ורוחניות בעולם המודרני. הלימודים בחוג כוללים הכרה עם ספרות התלמוד, המדרש והאגדה, עם המיסטיקה היהודית (קבלה וחסידות) , עם הגות ימי הביניים ועם המחשבה המודרנית והפוסט מודרנית.
הלימודים בחוג משלבים גישה תרבותית-פלורליסטית, המתמודדת עם שאלות הרוח בהווה, יחד עם גישה מחקרית המעניקה כלי מחשבה וידע כללי בתחומי דעת מגוונים (מיסטיקה, פילוסופיה כללית ודתות). אלה מאפשרים לסטודנט לגבש את זהותו היהודית-הישראלית ואת זהותו ההומניסטית-האוניברסאלית.
*תוכנית "יובלים" להכשרת מדריכים למחנות קיץ יהודיים בחו"ל: הלומדים בחוג יכולים להצטרף לתוכנית לימודים ייחודית שבסופה יוצאים הסטודנטים להדרכה במחנה קיץ יהודי בחו"ל. תוכנית "יובלים" מוצעת גם כחלק מלימודי מקבץ העם היהודי