לימודי ה-MA בלימודי ארץ ישראל, מיועדים להרחיב ולהעמיק את הידע וההבנה של התלמיד בהיסטוריה, גיאוגרפיה היסטורית, אנתרופולוגיה ונושאי חברה ומדינה של ארץ-ישראל ומדינת ישראל. כמו כן, ירכוש התלמיד כלים ושיטות הדרושים למחקר עצמאי של ארץ-ישראל ומדינת ישראל.
התלמידים יתמחו באחד מהתחומים:
העת החדשה או העת העתיקה.
קיימים שני מסלולי לימוד:
מסלול הכולל הגשת עבודת גמר מחקרית (תזה) ובחינת גמר.
מסלול הכולל בחינות גמר (ללא עבודת גמר).