מטרת התכנית של תואר ראשון במנהל מערכות בריאות, היא להכשיר סטודנטים לתפקידים מובילים ארגוניים וניהוליים בכל רבדיה של מערכת הבריאות הכוללים בין היתר: ניהול וארגון שירותי בריאות במגזר הציבורי והפרטי, מזכירות רפואית, ניהול טכנולוגיות רפואיות מתקדמות, ניהול בסיעוד, ניהול בתעשייה ותכנון, ניהול וקביעת מדיניות בריאות.
התכנית נועדה להכשיר את בוגריה ברמה המדעית והיישומית בנושאים ניהוליים, ארגוניים ותכנוניים במערכת הבריאות על ידי מיטב המרצים בישראל.
התכנית בנויה משלושה שלבים:
1. קורסי מבוא מתחום הניהול הכללי והכלכלי - המעניקים תשתית ידע ניהולית הנדרשת מכל מנהל, ללא קשר לענף בו הוא נמצא. קורסים לדוגמא: יסודות הניהול, יסודות התנהגות ארגונית, יסודות החשבונאות, מבוא לכלכלה, מבוא למימון, מבוא לסטטיסטיקה, אנגלית.
2. קורסי בסיס בכלכלת בריאות וניהול רפואי - מקנים לבוגרים ידע בבסיס הרפואה (מחלות) ומושגים בסיסיים בעולם הניהול הרפואי. קורסים לדוגמא: מורה נבוכים בעולם הרפואה, מבוא למערכת הבריאות בישראל ובעולם, מבוא לבריאות הציבור, אפידמיולוגיה ושיטות מחקר, יסודות השיווק במערכת הבריאות, מבוא לביטוחי בריאות.
3. קורסי ניהול מתקדמים בכלכלת בריאות וניהול רפואי - מקנים לבוגרים כלים ניהוליים ממוקדים לניהול במערכות הבריאות בישראל. קורסים לדוגמא: ניהול טכנולוגיות רפואיות, ניהול איכות שירותי הבריאות, ניהול בתי חולים, ניהול קופ"ח, רפואה שמחוץ לסל שירותי הבריאות, שיטות מתקדמות ויישומים סטטיסטיים בניתוח נתונים בתחום הבריאות, היבטים כלכליים במערכת הבריאות בישראל, מבוא לאינפורמטיקה רפואית, רפואה ומשפט, אתיקה רפואית, תקשורת ובריאות.