תואר שני בניהול מערכות חינוך לקציני צה"ל ומשרתי מערכת הביטחון, מאפשרת לסטודנטים המשרתים בצה"ל ובמערכת הביטחון להיחשף לידע מתחומי הניהול, משאבי אנוש, חקר ארגונים, כלכלה ומשפט ולהתמחות בנושאים הקשורים למנהיגות חינוכית, מדיניות ופיתוח ארגוני.
לימודי תואר שני אלו מתבססים על מספר עקרונות:
גישה בין- תחומית המדגישה קדמת הידע הקיים בניהול ארגונים כללים, תוך יישום ידע זה לתוך ההקשר הספציפי של מערכות חינוכיות ומתוך תפיסה כוללת וערכית של מערכות חינוך בישראל.
התפתחות אישית שתעשה בשילוב גיבוש חזון אישי ופיתוח מודעות להקשר הרחב, הערכי והבינתרבותי של מערכות חינוך. כולל קורסים בעלי אופי סדנתי המנתחים את תהליכי ההתנהגות של הלומדים כמנהיגים וכמנהלים.
הכשרה מעשית שמטרתה חיבור בין תיאוריה למעשה. תהליך זה יכלול חונכות. במסגרת התכנית ילווה הסטודנט מנהל בית ספר, אשר ישמש כחונך בתהליך הלמידה.
* בסיומה של התכנית תיערך בחינת סיום תואר שני.