המסלול מבוסס על שיתוף פעולה בין החוגים לביולוגיה אבולוציונית ומדעי המחשב באוניברסיטת חיפה, ומאפשר לתלמידי מחקר להתמחות בביואינפורמטיקה עם דגש אבולוציוני. התואר יקנה כלים תיאורטיים ומעשיים המשמשים למחקר הביואינפורמטי. ילמדו כלים מתחומים כגון למידה חישובית, הסקה סטטיסטית, אלגוריתמים והסתברות, המשמשים למחקר בגנומיקה, גנטיקה, פרוטאומיקה, פילוגנזה, ועוד.
התכנית היא מחקרית וכוללת כתיבת עבודת גמר מחקרית (תזה), ומיועדת לתלמידים מצטיינים לתואר מוסמך. תכנית הלימודים כוללת קורסי חובה וקורסי התמחות שיותאמו לתכנית המחקר של כל תלמיד בתיאום עם יועצי התכנית. התלמידים יידרשו לקורסי השלמה בהתאם להכשרה הקודמת שלהם.
קורסים והתמחויות: ביולוגיה מערכתית, ביולוגיה מבנית חישובית, גנטיקה וגנומיקה סטטיסטית, אלגוריתמים בביולוגיה חישובית, אבולוציה אורגניזמית, ביוכימיה לביואנפורמטיקאים, שיטות פילוגנטיות, קודים גנטיים.