ההתמחות המבוקשת ביותר בארץ ובעולם הינה במערכות מידע. היא מקנה לסטודנטים ידע מעמיק בניהול, השבחה ופיתוח של טכנולוגיית המידע. מערכות מידע הן כלי הכרחי בכל עסק, ולפיכך מחזורי תעשיית המידע הם מהגדולים במשק העולמי ונדבך חשוב בעסקים. הנדסאי תעשיה וניהול בוגר ההתמחות במערכות מידע הינו בעל ידע בתחום לימודי הנדסה תעשיה וניהול כמו גם בתחום המחשבים והמידע. בנוסף יהיה הנדסאי תעשיה וניהול בוגר ההתמחות במערכות מידע בקיא במכלול הכלים והטכנולוגיות הרלוונטיים והחדשים ביותר בתחום, ויהיו מוכנים להשתלב בעולם מערכות המידע.
מקצועות הלימוד העיקריים בתחום מערכות המידע הם:
- אינטרנט ואוטוסטראדת המידע.
- ניהול מערכות מידע.
- תכנות מערכות.
- ניתוח מערכות מידע.
- יישומי גיליונות חישוב אלקטרוניים בתעשייה.
- תקשורת נתונים ותכנות בסביבת האינטרנט.
עם סיום לימודיהם, מתנסים תלמידי תואר הנדסאי תעשייה וניהול, בהכנתו של פרויקט גמר, באמצעותו הם מציגים ידע, מיומנות ויכולת, הנדרשים מבעל תואר הנדסאי תעשייה וניהול. בפרויקט מתנסים הסטודנטים בכל הנושאים שנלמדו במהלך המסלול, בלימוד עצמי ובמימוש רעיונות והרגלי עבודה על פי הסטנדרטים של התעשייה ושל האקדמיה. פרויקט זה גם יכול לשמש ככרטיס הכניסה לשוק העבודה ואף להוות בסיס ליזמות עסקית.