מגמת הלימודים בהתמחות בנוסף להענקת ידע וכלים להבנת המורשת, הינה להביא את הסטודנטים להפנמת הערכים הייחודיים והאוניברסילים, המצויים במקורות היהדות, להכרת המורכבות של הזהות היהודית ולטפח את פוטנציאל הדיאלוג בין בעלי גישות שונות למורשת. כל אלה במטרה להנחילם לחניכים בבתי הספר בהתאם לגילם.
בין נושאי הלימוד:
לימודי חובה כלליים, חג ומועד, יסודות בספרות חז"ל, הסיפור המקראי - מבחר סיפורים מן התורה, לימודי התמחות, פרקים נבחרים במלכים א‘ ו- ב‘, ספרי נביאים ראשונים / פרקים נבחרים בספרי שופטים ושמואל, תמורות בעולם היהודי בעת החדשה, דידקטיקה של המקרא + יהדות, יציאת מצרים והנדודים במדבר, עיון אינטגרטיבי בסיפורי האבות, תמורות בעולם היהודי בעת החדשה, עיון משווה במקרא - קורס מתקדם ומעגל השנה בבית הספר.